Владимир Николаевич Никольский — автор более 250 научных статей, 14 монографий, более 150 публицистических статей во всеукраинской и региональной периодической печати.

В 1993 г. впервые выступил на Всеукраинской научной конференции в Луцке с докладом «Репрессии Государственного политического управления против религиозных деятелей Донбасса в 1920-е годы (по документам Управления Службы безопасности Украины в Донецкой области». В 1994 г. в научном журнале «Новые страницы истории Донбасса» была напечатана фундаментальная статья «Религиозные течения и группировки в Донбассе середины 1920-х годов». В 1995 г. выступил на 7-й Всеукраинской конференции по историческому краеведению в Черкассах с докладом «Статистика религиозных преследований на Донетчине в 1937-1938».

В 1937 г. в сборнике «Правда через годы …» выходит первая из серии статей, посвященных жизни и деятельности бывшего духовника семьи российского императора Николая II (в начале 1920-х гг. священника Свято-Преображенского собора в Сталино (Донецке) протоиерея Поликарпова — «Дело протоиерея Поликарпова». В дальнейшем ученый неоднократно в своих публикациях возвращался к этой фигуре.

В 1998 г. В.М. Никольский во втором выпуске научного сборника «Правда через годы…» печатает статью «Главная ошибка церковной политики …».

Вопрос преследований по религиозным причинам раскрыт в статьях «Статистика политических репрессий 1937 г. в Украинской ССР» (научный журнал «Из архивов ВУЧК-ГПУ-НКВД-КГБ», 2000 г.), «Резонансные дела» Государственного политического управления УССР (1921 — 1934 )» (в научном сборнике «Новые страницы истории Донбасса», 2000 г.), «…как пройдет, будет проходит «термидор» в СССР » (научный сборник «Правда спустя годы… Выпуск пятый», 2001 г.», «Обвинение по политическим мотивам в Украине в 1937-1938 гг.» (научный сборник «Правда спустя годы… Выпуск шестой.», 2003 г.), «Приговоры и решения судов и внесудебных органов о репрессированных по политическим мотивам на Украине в 1937-1938 гг» («Вестник Донецкого университета», 2003 г.), » Массовая операция» органов НКВД 1937-1938 гг. на Украине: развертывание и последствия» (научный журнал «Исторические и политологические исследования «, 2004), «Репрессии за «лимитами» («Украинский исторический журнал», 2006 г.) и многих других публикациях.

В 2003 году выходит фундаментальная монография профессора В.М. Никольского «Репрессивная деятельность органов государственной безопасности СССР в Украине (конец 1920-х — 1950-е гг.) Историко-статистическое исследование» (объемом 624 страницы), в которой значительное место занимают материалы преследований православных священников и церковных активистов-мирян.

В девятой книге тома «Реабилитированные историей. Донецкая область» (2012 г.) печатается результат многолетней работы профессора В.М. Никольского -большая статья «Репрессии против православного духовенства Донецкой в 1920 — 1949 гг. в количественных измерениях», в которой впервые представлены данные о масштабах и направленности репрессий, проанализированы их последствия.

Ученый регулярно выступает на телевизионных каналах «КРТ», «ТРК Украина», «1 +1», «Интер» (Киев), 27-й канал, 1-й муниципальный (Донецк), «Орбита» (Красноармейск), на областном радио по вопросам политических репрессий в СССР, в том числе — по религиозным мотивам. Имеет много публикаций по этим вопросам в печати.

Как заместитель заведующего кафедрой истории Украины, В.М. Никольский постоянно осуществляет помощь работникам и слушателям курсов духовной культуры при историческом факультете Донецкого национального университета.

Профессор В.М. Никольского награждены почетными знаками «Отличник образования Украины», «Петр Могила» Министерства образования и науки Украины, он получил Благодарность Министерства культуры и искусств Украины «За значительный личный вклад в развитие украинской культуры», неоднократно отмечен Почетными грамотами городского совета, донецкого областного совета и Донецкой областной государственной администрации.